MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Actinoplanes missouriensis 431

Total Repeats: 19127

< Previous12...27282930313233343536373839Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19001	NC_017093	CCGA	2	8	8742613	8742620	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
19002	NC_017093	GCC	2	6	8742636	8742641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19003	NC_017093	AGCCG	2	10	8742648	8742657	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
19004	NC_017093	GCCGA	2	10	8742664	8742673	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
19005	NC_017093	CTG	2	6	8742701	8742706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19006	NC_017093	GCC	2	6	8742711	8742716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19007	NC_017093	ACGC	2	8	8742722	8742729	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
19008	NC_017093	CCGG	2	8	8742730	8742737	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19009	NC_017093	ACC	2	6	8742738	8742743	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19010	NC_017093	CTG	2	6	8742770	8742775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19011	NC_017093	TCG	2	6	8742778	8742783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19012	NC_017093	AGC	2	6	8742795	8742800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19013	NC_017093	TTC	2	6	8742861	8742866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19014	NC_017093	CCGA	2	8	8742892	8742899	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
19015	NC_017093	CGG	2	6	8742902	8742907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19016	NC_017093	TTC	2	6	8742913	8742918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19017	NC_017093	AG	3	6	8743437	8743442	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19018	NC_017093	CA	3	6	8743475	8743480	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19019	NC_017093	GC	3	6	8743515	8743520	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19020	NC_017093	AGGG	2	8	8743577	8743584	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
19021	NC_017093	GGCC	2	8	8745387	8745394	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19022	NC_017093	CGT	2	6	8745397	8745402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19023	NC_017093	GGCC	2	8	8745404	8745411	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19024	NC_017093	CACC	2	8	8745443	8745450	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
19025	NC_017093	CCG	3	9	8745492	8745500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19026	NC_017093	CG	3	6	8747657	8747662	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19027	NC_017093	G	6	6	8753644	8753649	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
19028	NC_017093	CGC	2	6	8757248	8757253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19029	NC_017093	GCG	2	6	8757262	8757267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19030	NC_017093	GAG	2	6	8757279	8757284	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19031	NC_017093	CTT	2	6	8758632	8758637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19032	NC_017093	TTC	2	6	8758645	8758650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19033	NC_017093	C	6	6	8758650	8758655	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
19034	NC_017093	C	6	6	8760495	8760500	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
19035	NC_017093	C	6	6	8760539	8760544	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
19036	NC_017093	GGT	2	6	8760618	8760623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19037	NC_017093	ACC	2	6	8760652	8760657	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19038	NC_017093	CGT	2	6	8762983	8762988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19039	NC_017093	TCG	2	6	8763005	8763010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19040	NC_017093	CGCCGG	2	12	8763037	8763048	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19041	NC_017093	CGCCGG	2	12	8763078	8763089	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19042	NC_017093	CGT	2	6	8763093	8763098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19043	NC_017093	CCG	2	6	8763118	8763123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19044	NC_017093	GCC	2	6	8763142	8763147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19045	NC_017093	GC	3	6	8763156	8763161	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19046	NC_017093	AGG	2	6	8764056	8764061	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19047	NC_017093	ACG	2	6	8764084	8764089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19048	NC_017093	ACCC	2	8	8764105	8764112	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
19049	NC_017093	CATC	2	8	8764159	8764166	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
19050	NC_017093	ACG	2	6	8764218	8764223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19051	NC_017093	CA	4	8	8764323	8764330	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19052	NC_017093	AGC	2	6	8764511	8764516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19053	NC_017093	AGGC	2	8	8764554	8764561	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
19054	NC_017093	GGC	2	6	8764585	8764590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19055	NC_017093	GCGCT	2	10	8764604	8764613	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
19056	NC_017093	CA	3	6	8764629	8764634	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19057	NC_017093	CG	3	6	8764650	8764655	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19058	NC_017093	CGCA	2	8	8764762	8764769	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
19059	NC_017093	GCA	2	6	8764812	8764817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19060	NC_017093	GCTCC	2	10	8764820	8764829	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
19061	NC_017093	CGG	2	6	8764857	8764862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19062	NC_017093	CGG	2	6	8764879	8764884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19063	NC_017093	GGC	2	6	8764886	8764891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19064	NC_017093	GCC	2	6	8764894	8764899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19065	NC_017093	CTC	2	6	8764939	8764944	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19066	NC_017093	GCA	2	6	8764971	8764976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19067	NC_017093	GCCC	2	8	8765028	8765035	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
19068	NC_017093	CGA	2	6	8765047	8765052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19069	NC_017093	GCG	2	6	8765061	8765066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19070	NC_017093	CT	3	6	8765109	8765114	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19071	NC_017093	GTAT	2	8	8765132	8765139	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
19072	NC_017093	CGC	2	6	8765160	8765165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19073	NC_017093	CCGGT	2	10	8765194	8765203	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
19074	NC_017093	GCT	2	6	8765214	8765219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19075	NC_017093	CCG	2	6	8765235	8765240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19076	NC_017093	GC	3	6	8765243	8765248	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19077	NC_017093	TGA	2	6	8765296	8765301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19078	NC_017093	AC	3	6	8765318	8765323	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19079	NC_017093	GCT	2	6	8765402	8765407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19080	NC_017093	GGC	2	6	8765470	8765475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19081	NC_017093	CGGA	2	8	8765507	8765514	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
19082	NC_017093	GCT	2	6	8765522	8765527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19083	NC_017093	CGC	2	6	8765538	8765543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19084	NC_017093	CGAT	2	8	8765550	8765557	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
19085	NC_017093	CTC	2	6	8765560	8765565	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19086	NC_017093	CCGGC	2	10	8765591	8765600	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
19087	NC_017093	GCCC	2	8	8765630	8765637	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
19088	NC_017093	GCCCG	2	10	8765663	8765672	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
19089	NC_017093	CTG	2	6	8765696	8765701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19090	NC_017093	GGC	2	6	8765848	8765853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19091	NC_017093	GGA	2	6	8765932	8765937	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19092	NC_017093	GTC	2	6	8766028	8766033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19093	NC_017093	CTGG	2	8	8766078	8766085	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
19094	NC_017093	CTGA	3	12	8766086	8766097	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
19095	NC_017093	TCC	2	6	8766131	8766136	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19096	NC_017093	CGC	2	6	8766271	8766276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19097	NC_017093	CCAAC	2	10	8766409	8766418	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
19098	NC_017093	GAG	2	6	8766437	8766442	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19099	NC_017093	CGC	4	12	8766459	8766470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19100	NC_017093	TC	3	6	8766485	8766490	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19101	NC_017093	ATCA	2	8	8766497	8766504	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
19102	NC_017093	CCG	2	6	8766568	8766573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19103	NC_017093	CCCG	2	8	8768677	8768684	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
19104	NC_017093	CGG	2	6	8768764	8768769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19105	NC_017093	CAGC	2	8	8769028	8769035	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
19106	NC_017093	TGA	2	6	8769074	8769079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19107	NC_017093	GTC	2	6	8769092	8769097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19108	NC_017093	CAA	2	6	8769163	8769168	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19109	NC_017093	ATC	2	6	8769262	8769267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19110	NC_017093	CACC	2	8	8769288	8769295	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
19111	NC_017093	GCCC	2	8	8769364	8769371	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
19112	NC_017093	CAA	2	6	8769399	8769404	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19113	NC_017093	GGA	2	6	8769412	8769417	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19114	NC_017093	CCG	2	6	8769423	8769428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19115	NC_017093	GGGT	2	8	8769527	8769534	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
19116	NC_017093	CTC	2	6	8769535	8769540	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19117	NC_017093	CGG	2	6	8769547	8769552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19118	NC_017093	GAG	2	6	8770424	8770429	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19119	NC_017093	GAG	2	6	8770442	8770447	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19120	NC_017093	GGGA	2	8	8770458	8770465	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
19121	NC_017093	ACG	3	9	8770488	8770496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19122	NC_017093	CGTGG	2	10	8770536	8770545	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
19123	NC_017093	TAC	2	6	8773056	8773061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19124	NC_017093	CGG	2	6	8773105	8773110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19125	NC_017093	CAG	2	6	8773190	8773195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19126	NC_017093	GGGC	2	8	8773246	8773253	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
19127	NC_017093	GCG	2	6	8773335	8773340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding

< Previous12...27282930313233343536373839Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.